1 由符合條件的企業、合作社或個人提出申請，并向縣級農業工作機構提交相關申報材料。
2 縣級農業工作機構審核，符合條件的，填寫推薦意見，負責人簽字，加蓋機構印章，連同申報材料報市綠辦。
3 市綠辦進行審核，符合條件的，組織檢查員進行現場檢查，編制《現場檢查報告》等材料，填寫推薦意見，負責人簽字，加蓋機構印章，連同申報材料報省綠辦。
4 省綠辦審核，符合條件的，填寫推薦意見，負責人簽字，加蓋機構印章，連同申報材料報中國綠色食品發展中心。
5 中國綠色食品發展中心進行終審，對符合條件的頒發綠色食品證書，并與綠色食品申報企業簽訂標志使用合同，辦理相關手續。
【法律依據】：《綠色食品標志管理辦法》
第二條 本辦法所稱綠色食品，是指產自優良生態環境、按照綠色食品標準生產、實行全程質量控制并獲得綠色食品標志使用權的安全、優質食用農產品及相關產品。
第三條 綠色食品標志依法注冊為證明商標，受法律保護。
第四條 農業部依法對全國綠色食品及綠色食品標志進行監督管理。縣級以上地方人民政府農業行政主管部門依法對本行政區域綠色食品及綠色食品標志進行監督管理。
第五條 中國綠色食品發展中心負責全國綠色食品標志使用申請的審查、頒證和頒證后跟蹤檢查工作。
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