申請國家高新技術企業(yè)的條件對于很多企業(yè)來說是比較苛刻的，八個方面的要求都得滿足，如有其中一條不滿足都不能申請高新技術企業(yè)。這八個條件企無憂就不再重復說明了。條件有這么多，審查又這么嚴格，自然而然，就有許多企業(yè)不能成功通過高新技術企業(yè)認定。
一、主觀存在的問題，就是企業(yè)人員造成的問題。
1.不理解、不清楚新政策。不少企業(yè)沒有關注新的國家高新技術企業(yè)認定工作指引，對于新的管理辦法不太了解，在準備資料的過程中，仍然按照往年的思路進行，結果資料不完備，從而導致無法通過認定。
2.不重視本次認定。部分企業(yè)員工受了一些培訓機構的講解后，認為資料準備相對簡單，沒有系統(tǒng)的安排重新認定的準備工作、投入足夠的人力，結果認定準備混亂，資料無法體現(xiàn)企業(yè)材高新資質(zhì)，最終也無法通過認定。
3.企業(yè)內(nèi)部工作不能夠協(xié)調(diào)。國家高新技術企業(yè)認定工作涉及財務、技術、人力等諸多部門，由于事前未能統(tǒng)一理解高新認定的新標準，導致部門配合不協(xié)調(diào)，資料準備不一致，拖延了申報高新技術企業(yè)的過程、甚至無法完成年度的申報。認定高新技術企業(yè)要先了解企業(yè)情況!
二、客觀上存在的問題，就是企業(yè)自身資質(zhì)問題。
客觀問題可以從高新技術企業(yè)申報條件和四個評分項來總結：
(一)技術性指標不達標
1.高新領域無法界定。
由于此次高新領域的調(diào)整，原有的部分領域被刪除或簡化，同時新的領域在某些部分存在含糊，規(guī)定甚為籠統(tǒng)。因此不少企業(yè)無法找到完全貼合企業(yè)產(chǎn)品或高新技術的領域，從而導致企業(yè)在申報高新技術企業(yè)認定時出現(xiàn)領域選擇不準確而無法通過評審的情況。
2.核心自主知識產(chǎn)權缺乏。
由于中國專利保護力度仍然在完善當中，當企業(yè)擁有了行業(yè)領先的技術后，一般不太愿意進行公開專利申請。這就導致很多企業(yè)雖然具有符合高新領域的技術或產(chǎn)品，其相應的技術等也的確達到國內(nèi)甚至國際領先水平，但囿于專利申請的限制，依然無法達到申報高新技術企業(yè)認定的要求。
3.項目歸集困難。
(二)財務性指標不足
1.研發(fā)費用不足
2.高新收入達不到標準
企業(yè)高新產(chǎn)品的收入一般容易核算。但一些從事高新技術服務的企業(yè)則存在問題，由于原有管理的缺失，許多企業(yè)材技術服務收入并未在技術市場進行登記，或登記的合同實際收入未滿總收入的60%。隨著高新認定工作的進一步完善，技術服務收入的合同必須登記將成為國家高新技術企業(yè)認定申報的必備條件。
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