ISO14001認證的審核類型有三種:第一方審核，即通常所說的內部審核;第二方審核，即相關方審核;第三方審核，即認證/注冊審核。三種類型審核的方法基本相同，目的各不相同。對于環境和
職業健康安全管理體系來說，三種審核的目的分述如下。
第一方審核(內部審核)的目的:通過審核找出可予改進的方面，不斷完善組織的環境和職業健康安全管理水平，提高組織的環境和職業健康安全績效。
第二方審核(相關方審核)的目的:通過審核了解組織的環境和職業健康安全績效，以證實組織對環境和職業健康安全承諾，確定是否與之建立合作關系。
第三方審核(認證審核)的目的:檢查組織的環境和職業健康安全管理體系是否符合ISO14001標準和OHSAS 18001標準要求、環境和職業健康安全管理體系運行是否有效、環境和職業健康安全行為是否符合相關法律法規的要求，以確定組織能否認證/注冊。
審核是一個系統的、獨立的過程，所以在過程實施時應形成系統文件，如審核方案(計劃)、審核過程的時間和人員安排、審核報告等。
審核過程通常可分為三個部分:首先是通過觀察、提問、檢查等方法獲得客觀證據，然后將獲得的客觀證據與審核準則相比較，以判定所獲得的證據符合準則的程度，形成審核發現，最后以審核發現為依據，綜合評價組織建立和運行的環境和職業健康安全管理體系滿足審核準則的程度，得出審核結論。
為了保證審核的獨立性和公正性，內部審核人員應審核與自己無責任關系的部門或要素。
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